Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms