Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND2AQ9ULE3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms