Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP21Q9UK80 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP21Q9UK80 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms