Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN11AQ9UI33 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms