Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP68Q9UHB9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRP68Q9UHB9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms