Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKIRAS2Q9NYR9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NKIRAS2Q9NYR9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms