Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MS4A12Q9NXJ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms