Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT57Q9NWB7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT57Q9NWB7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT57Q9NWB7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms