Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ASCL3Q9NQ33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms