Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPJQ9HC77 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPJQ9HC77 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms