Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C11orf49Q9H6J7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms