Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM3Q9BZL3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms