Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHEK2-206ENST00000402731 1545 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSFY1-204ENST00000382856 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMRAL2P-201ENST00000306399 891 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGB3BP-202ENST00000371092 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC024082.1-201ENST00000435250 699 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00379-202ENST00000438789 464 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093871.1-201ENST00000503815 534 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC169-213ENST00000510088 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 WASH3P-206ENST00000559884 427 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079210.1-201ENST00000589826 384 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004004.1-201ENST00000603784 250 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031593.1-201ENST00000623197 865 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010894.5-201ENST00000624428 951 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FILIP1L-204ENST00000398326 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013391.3-201ENST00000567484 1456 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFIB-219ENST00000636735 1471 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP163-201ENST00000363221 330 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms