Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB11FIP5Q9BXF6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms