Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GAL3ST1Q99999 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms