Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD5Q99666 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGPD5Q99666 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms