Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCAF11Q99590 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCAF11Q99590 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms