Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRP3Q96P20 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms