Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96MF0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96MF0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96MF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms