Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLMNQ96JQ2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLMNQ96JQ2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms