Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM4SF18Q96CE8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms