Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP9XQ93008 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms