Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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FAT3Q8TDW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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FAT3Q8TDW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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FAT3Q8TDW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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FAT3Q8TDW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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FAT3Q8TDW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
FAT3Q8TDW7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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