Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLX4Q8IY92 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms