Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SSX7Q7RTT5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SSX7Q7RTT5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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