Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HECW1Q76N89 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms