Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP31Q70CQ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP31Q70CQ4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms