Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM43BQ6ZT52 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
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