Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSSK4Q6SA08 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms