Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF7Q6Q0C0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms