Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42EP5Q6NZY7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42EP5Q6NZY7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms