Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD54Q6NXT1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms