Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM29Q5VYK3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECM29Q5VYK3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms