Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C9orf84Q5VXU9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms