Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACHD1Q5VU97 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACHD1Q5VU97 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACHD1Q5VU97 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACHD1Q5VU97 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACHD1Q5VU97 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms