Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms