Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC93Q567U6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms