Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM259Q4ZIN3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM259Q4ZIN3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms