Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP41Q3LFD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP41Q3LFD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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