Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6AP1Q15904 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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