Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC85BQ15834 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC85BQ15834 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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