Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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