Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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