Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CBFBQ13951 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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