Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCINQ13939 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CCINQ13939 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCINQ13939 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCINQ13939 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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