Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ITGA9Q13797 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGA9Q13797 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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