Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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