Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ATRQ13535 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRQ13535 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRQ13535 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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