Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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