Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SRSF5Q13243 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SRSF5Q13243 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms